离开灵魂摆渡的世界后，王汉回到秦时明月的世界安排下今后的事情，便拿着天地之书寻了一个灵气充裕，时间流速快的时间进行闭关，领悟天地之书中的天地生死法则和命运法则。
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时间匆匆流逝，转眼间时间便过去了五千年。五千年的时间，黑暗王朝对奥特曼宇宙的进攻依旧还在继续，但是却已经接近尾声。
五千年来，由黑暗王朝发起的战争波及了整个奥特曼宇宙世界，黑暗王朝的亡灵部队不断的输送进奥特曼世界，又不断的训练出新的亡灵军团，生产新的战舰，组建出一支支新的亡灵舰队，不断增加着黑暗王朝在奥特曼世界的侵略力量。
面对黑暗王朝的侵略，奥特曼世界那些不愿被黑暗王朝统治和支配的宇宙种族们也联合组成了大大小小的反抗联盟，如同雨后春笋一般不断冒出，反抗着黑暗王朝的侵略。五千年来，这样的联盟一个个的形成，少则两三个文明，多则几十上百个，甚至数千个文明组成，但是他们的结果就是一个个的被黑暗王朝消灭，不留下任何反抗的活口。
这场战争，一打就是五千年，越来越激烈，死亡越来越多，并且还在继续，整个奥特曼宇宙也被打得乌烟瘴气。
战争遗留下的各种宇宙种族的尸体和亡灵的骸骨，巨大怪兽的残肢在宇宙的虚空之中随处可见，各种宇宙战舰的残骸和被炸毁的星球的碎片成为了宇宙中新的垃圾。
有反抗者，也就有屈服者，面对黑暗王朝的强大力量，面对亡族灭种的下场，更多的宇宙种族选择了屈服，接受黑暗王朝的奴役。还有投机者，在黑暗王朝的强大力量下，选择了投靠，挂上了附庸于黑暗王朝的旗帜，共同侵略其他种族，以此来为自己争取种族存活并且变得更强大的机会。
但是如今，战争已经要接近尾声了，三百年前，一个由七千个文明组成的最大的反抗联盟因为内部接连出现叛变种族，终于被黑暗王朝的亡灵部队抓住了机会，集结了数千个大型的亡灵舰队(大型舰队，战舰数量达到一万艘战舰。)，以绝对的优势围剿消灭了这个联盟的主力，并且围点打援，重创甚至消灭了不少前来救援的反抗联盟势力，清剿了大量的反抗文明，之后反抗的势头便弱了许多。
宇宙的边缘，某个未知的角落之中，黑暗王朝一个千膄战舰组成的中型舰队正在和一个小型的反抗联盟激烈的交战着，值得一提的是这个小型反抗联盟的宇宙战舰科技居然快赶上黑暗王朝亡灵部队的战